В течение длительного времени проводились учеными кафедры «Прикладная математика» научные исследования в рамках программы Российско-польского научного сотрудничества с университетом Николая Коперника и с Зеленогурским университетом (Польша), а также с университетом Саутгемптона (Великобритания) при поддержке РФФИ и Польского национального научного центра. В 2017 году была продолжена инициативная работа кафедры «Прикладная математика» по фундаментальному исследованию (проект «Моделирование и синтез робастного управления повторяющимися процессами в задачах промышленной и медицинской робототехники») в рамках международного сотрудничества Великобритания – Россия (руководители П.В. Пакшин – АПИ НГТУ, Россия, и Э. Роджерс – Королевское общество, Великобритания). Результаты инициативной работы – публикация статей в журналах «Автоматика и телемеханика», в трудах IFAC, IEEE.
Заведующий кафедрой «Прикладная математика» д.ф.-м.н. профессор Пакшин П.В. является членом редколлегий многих престижных международных журналов и членом Программных комитетов ряда международных конференций.